La Comisión Nacional de Energía Atómica (CNEA) creó en el año 2007 el Instituto de Nanociencia y Nanotecnología (INN), con el objetivo de  potenciar  la investigación multidisciplinaria en nanociencia, el desarrollo de micro y nanotecnologías, el fortalecimiento del trabajo transversal e interdisciplinario y la generación de proyectos tecnológicos estratégicos para la institución. Dentro de la estructura de CNEA, el INN es la GERENCIA DE NANOCIENCIA Y NANOTECNOLOGÍA que depende de la GERENCIA DE ÁREA INVESTIGACIÓN, DESARROLLO E INNOVACIÓN de la Institución. En el mes de julio de 2017 se firmó un Acuerdo Específico entre CNEA y CONICET conducente a “la creación de la Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología”, con el fin  de  transformar al INN en una Unidad Ejecutora de doble dependencia CNEA – CONICET. En febrero de 2018 el Directorio de CONICET aprobó la creación de la Unidad Ejecutora Instituto de Nanociencia y Nanotecnología (UE-INN) como Unidad Ejecutora de doble dependencia COMISIÓN NACIONAL DE ENERGÍA ATÓMICA - CONICET.

La UE-INN está integrada por dos nodos: el  Nodo Bariloche, que se encuentra en el Centro Atómico Bariloche (CAB) y el Nodo Constituyentes, perteneciente al Centro Atómico Constituyentes (CAC). Entre ambos hacen un total de 252 agentes. El INN se organiza alrededor de dos Consejos Zonales, uno en cada nodo. La sede del Director/a  (jefe de departamento) se alterna entre Buenos Aires y Bariloche.

La UE-INN es una organización transversal e interdisciplinaria que coordina actividades en nanociencia, nanotecnología y microtecnología que se desarrollan en distintas gerencias de la CNEA. Se realizan dentro de este  marco  investigaciones y desarrollos innovadores en diversos temas entre los que se destacan los vinculados a la energía, a la bio y nano-medicina y al diseño y fabricación de nano y micro materiales y dispositivos. Dentro del INN investigadores y tecnólogos pertenecientes a distintos grupos de trabajo de la CNEA  llevan adelante coordinadamente proyectos de investigación y desarrollo que involucran áreas de física, química, ciencia de materiales,  biología, entre otras. El Instituto desarrolla programas de colaboración con otras instituciones, tanto en el ámbito nacional como internacional  y organiza y co-organiza  reuniones anuales de investigadores y tecnólogos de todo el país, reuniones de las cuales fue precursor  y que se han transformado en el ámbito propicio para la presentación de los avances en sus áreas de incumbencia  y la planificación a futuro.